وافق مجلس التعليم العـــالي في الجلسة رقم 12/2007على إنشـاء أكاديمية الأمير حسين بن عبدا لله الثاني للحماية المدنية وتحت مظلة جامعة البلقاء التطبيقية وتعاون أكاديمي مع الجامعة الأردنية بهدف الإشراف على النواحي الأكاديمية وتنفيذ البرامج التعليمية المطروحة من حيث وضع الخطط الدراسية وإعداد المناهج وتدريس المواد وتم توقيع الاتفاقية بتاريخ 22/1/2008.

وبهدف وضع السياسة التعليمية للأكاديمية والتنسيب لإصدار الخطط الدراسية اللازمة  والتعليمات الخاصة المتعلقة بالدراسة في الأكاديمية بما في ذلك الرسوم الجامعية وشروط القبول والتسجيل وغيرها فقد تم تشكيل مجلس أعلى للأكاديمية برئاسة المدير العام للدفاع المدني وضم في عضويته (9) تسعة أشخاص بمناصب رفيعة من الجامعة الأردنية وجامعة البلقاء التطبيقية والمديرية العامة للدفاع المدني وعضوين يختارهما المدير العام ، كما وتم تشكيل مجلس الأكاديمية برئاسة عميد أكاديمية الأمير حسين بن عبدالله الثاني للحماية المدنية وعضوية أساتذة من الكليات المعنية في كل من الجامعة الأردنية وجامعة البلقاء التطبيقية وضباط من المديرية العامة للدفاع المدني .

أما بالنسبة للأمور المتعلقة بالتدريب التقني والإشراف الإداري  فإن الأكاديمية ستتولى هذا الجانب من خلال الكادر الإداري والتدريبي في المديرية العامة للدفاع المدني وخبراء مختصين.